収入合算、共有名義のローン。夫だけが全額ローン控除可能？

[匿名さん]

（似たようなスレッドがありますが、少し質問内容が違うので新規でつくります）

４０００万の物件を、頭金１０００万円（すべて妻名義預金から）、フラット３５、返済期間３５年で３０００万円借り入れ予定、収入は私５００万、妻も５００万です。
融資実行は来年です。
妊娠中の妻は一年以内（実行月よりは後です）に退職するので私単独で借りたかったのですが、毎月返済額が月収の４倍以上というところで微妙に厳しそうなので共有にする予定です。
私たちの考えでは、３０００万のローンは私、妻が頭金１０００万円を出すので持分割合は3：1（夫：妻）なのですが、これでよいのでしょうか？
仮にこの持分比率が問題なかったとして、住宅ローン控除はどうなるのでしょうか？
フラット３５の申し込みの時に収入合算で両者の収入を書き込むので懸念しています。
仕事を辞める妻の控除は必要ないと思っていますが、一年目から私一人が年末ローン残高の全額をローン控除受けることはできますか？
登記の持分比率によって残高の１/４しか控除されないのでしょうか？
もしくは、収入合算をしていたため、ローン残高の１/２しか控除されないのでしょうか？