設計仕様書通りに工事がされていない場合どうする？

[どっち]

大手ＨＭで建築中です。オプションで気密性能を高めるべく、床、天井、外壁部分に隙間をうめるテープやパッキンなどを使用してもらうことになっていましたが、現場を見てて、どれがその部分なのかわからなっかたので、担当者に訊ねてみたら、後から「何重かのミスが重なって、標準仕様で工事が進んでいます。」と謝られてしまいました。今から出来るところは、石膏ボードをはがしてすべてやり直すとのことですが、床が張られたところや、天井の一部は不可能とのこと。工期は延びるだろうし、下請け大工のモチベーションは下がるだろうし、柱には釘やネジの穴がいっぱい残るだろうし、せっかく熱交換換気システムにしたのに、効果減弱するだろうし・・・。どうしたらいいのやら・・・。